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高性能计算机平台
2017-12-04 15:37:10  来源:

高性能计算

生物技术研究中心专门搭建了生物信息学平台, 包括了机架式服务器和集群两种环境,全部由HPDELL服务器组成,采用高密度、高可靠、高可用、低功耗的体系结构设计。主要面向基因组分析、转录组分析和遗传育种分析等诸多研究提供高效稳定的计算服务。

目前,生物技术研究中心具有机架式服务器7台,集群系统1套,盘阵2套共72TB。计算网络采用40GbpsInfiniBand 的高性能通信网络。生物信息学平台安装丰富的软件使用环境,让数据更方便快捷。

信息学平台规章制度与相关表格

为确保生物技术研究中心生物信息学平台(以下简称“平台”)计算资源的合理、高效与规范使用,保证中

 

心科研工作顺利开展,特制定生物技术研究中心生物信息学平台管理办法。详细管理办法请下载参阅

 

为使用中心的生物信息学平台,新用户需填写开户申请单。因复杂运算需要,如需要申请更多计算资源,请

 

填写复杂运算申请表

 

服务器

处理器

内存

硬盘

机架式服务器

48

1T

1T

机架式服务器

46

256G

1T

机架式服务器

24

24G

2T

机架式服务器

24

36G

400G

集群

8X48

8X 256G

8X 600G

盘阵

带宽

硬盘

盘阵1

1Gbps

24TB

盘阵2

40Gpbs

48TB

软件列表

比对软件

, , , BWA, , Bowtie,  , , , , MAQ,

基因组组装软件

, , , , ,

,

转录组组装软件

Trinity

基因预测

EVM, ,

基因注释

,

重复序列识别软件

, , ,

进化分析软件

, ,

多态性检测

, , ,

数据库列表

蛋白数据库

UniprotKEGGNRzebrafishcommon carp

核酸数据库

Zebrafish, common carp

基因组数据库

Commoncarp , zebrafish

数据库信息

 

 

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